MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293 plasmid pLEUM1

Total Repeats: 329

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008496	CTT	2	6	336	341	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_008496	A	6	6	361	366	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008496	GCT	2	6	376	381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_008496	T	7	7	446	452	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008496	ATC	2	6	490	495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_008496	TTG	2	6	498	503	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008496	A	6	6	585	590	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008496	AATGC	2	10	645	654	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
9	NC_008496	AGAA	2	8	655	662	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008496	AGA	2	6	677	682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008496	A	6	6	1579	1584	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008496	ATT	2	6	1593	1598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008496	GGCT	2	8	1689	1696	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14	NC_008496	TA	3	6	3765	3770	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008496	GGA	2	6	4587	4592	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008496	ATG	2	6	5329	5334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008496	GCG	2	6	5412	5417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_008496	ATT	2	6	5427	5432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008496	CAA	2	6	5489	5494	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_008496	GC	3	6	5496	5501	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_008496	TGA	2	6	5539	5544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008496	GAC	2	6	5559	5564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_008496	CAA	2	6	5568	5573	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_008496	CAAT	2	8	5581	5588	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_008496	GT	3	6	5623	5628	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008496	AAC	2	6	5738	5743	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_008496	A	7	7	5757	5763	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008496	CTGG	2	8	5773	5780	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
29	NC_008496	A	6	6	5803	5808	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008496	A	8	8	5819	5826	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008496	AAT	2	6	5913	5918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008496	T	6	6	5986	5991	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008496	TA	3	6	5994	5999	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008496	CAC	2	6	6010	6015	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_008496	GA	3	6	6017	6022	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008496	A	7	7	6526	6532	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008496	ATT	2	6	6595	6600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008496	CTT	3	9	6627	6635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_008496	CAG	2	6	6654	6659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_008496	AAT	2	6	6700	6705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008496	CTG	2	6	6854	6859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_008496	A	6	6	6862	6867	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008496	T	6	6	6871	6876	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008496	ATT	2	6	6977	6982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008496	ACAA	2	8	6990	6997	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_008496	AAAC	2	8	7102	7109	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_008496	TGG	2	6	7212	7217	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008496	ATG	2	6	7227	7232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008496	AAT	2	6	7936	7941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008496	CGAA	2	8	7993	8000	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_008496	CAA	2	6	8073	8078	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_008496	ACA	2	6	8129	8134	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_008496	ACAA	2	8	8146	8153	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_008496	GAT	2	6	8276	8281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008496	CCAA	2	8	8286	8293	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_008496	CTGGAA	2	12	8342	8353	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_008496	CAT	2	6	8411	8416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_008496	ACA	2	6	9888	9893	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_008496	GGA	2	6	10023	10028	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008496	ATT	2	6	10054	10059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008496	GATC	2	8	10066	10073	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_008496	TA	3	6	10101	10106	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008496	TAT	2	6	10112	10117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008496	A	7	7	10128	10134	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008496	TA	3	6	10198	10203	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008496	AATT	2	8	10298	10305	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008496	TGC	2	6	10315	10320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_008496	T	7	7	10335	10341	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008496	ACC	2	6	10765	10770	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_008496	TAATTT	2	12	10773	10784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008496	AAC	2	6	10789	10794	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_008496	AATGC	2	10	10814	10823	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
73	NC_008496	TCT	2	6	10855	10860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_008496	ATT	2	6	10888	10893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_008496	ACC	2	6	10930	10935	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_008496	AATT	2	8	10991	10998	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008496	TGG	2	6	11010	11015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_008496	A	9	9	11056	11064	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008496	AAATT	2	10	11118	11127	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_008496	TAA	2	6	11183	11188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_008496	ATT	2	6	11201	11206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_008496	T	7	7	12325	12331	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_008496	T	6	6	12746	12751	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_008496	GTA	2	6	12754	12759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_008496	T	6	6	12768	12773	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_008496	TAT	2	6	12782	12787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_008496	TAA	2	6	12835	12840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_008496	TGGG	2	8	12851	12858	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
89	NC_008496	TGA	2	6	12863	12868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_008496	TAT	2	6	12892	12897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_008496	ATT	2	6	12899	12904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_008496	ATG	2	6	12918	12923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_008496	A	7	7	12929	12935	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_008496	ATTA	2	8	12956	12963	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_008496	AT	3	6	13071	13076	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_008496	A	6	6	13143	13148	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_008496	TTATAT	2	12	13467	13478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_008496	ATC	2	6	13519	13524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_008496	G	6	6	13596	13601	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
100	NC_008496	GTT	2	6	13726	13731	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_008496	CAA	2	6	13747	13752	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_008496	A	8	8	13751	13758	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_008496	TA	3	6	13924	13929	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_008496	TAT	2	6	13971	13976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_008496	TAAA	2	8	13983	13990	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_008496	A	7	7	13988	13994	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_008496	T	7	7	14028	14034	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_008496	TTTTCT	2	12	14721	14732	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_008496	A	6	6	14777	14782	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_008496	GA	3	6	14797	14802	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_008496	A	6	6	14834	14839	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_008496	T	9	9	14869	14877	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_008496	G	6	6	14927	14932	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
114	NC_008496	T	6	6	14958	14963	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_008496	GA	3	6	15075	15080	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_008496	GGT	2	6	15086	15091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_008496	CAA	2	6	15132	15137	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_008496	CGT	2	6	15192	15197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_008496	ATT	2	6	15244	15249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_008496	TA	3	6	15252	15257	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_008496	AG	3	6	15287	15292	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_008496	ATA	2	6	15842	15847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_008496	TAAT	2	8	15848	15855	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_008496	TTG	2	6	15864	15869	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_008496	CA	3	6	15877	15882	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_008496	TGT	2	6	15883	15888	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_008496	A	6	6	15981	15986	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_008496	T	9	9	16018	16026	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_008496	TAA	2	6	16051	16056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_008496	ACCA	2	8	16169	16176	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_008496	GCT	2	6	16180	16185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_008496	TGAA	2	8	16242	16249	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_008496	T	7	7	17264	17270	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_008496	AGTT	2	8	17319	17326	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_008496	AT	3	6	18587	18592	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_008496	TAA	2	6	18612	18617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_008496	T	7	7	18633	18639	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_008496	TAA	2	6	18702	18707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_008496	AT	3	6	18721	18726	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_008496	ATT	2	6	18750	18755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_008496	TAT	2	6	18780	18785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_008496	CATAAA	2	12	18789	18800	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
143	NC_008496	TAAT	2	8	18807	18814	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_008496	TTA	2	6	18815	18820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_008496	CCA	2	6	18833	18838	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
146	NC_008496	TATAT	2	10	18893	18902	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_008496	TGT	2	6	18916	18921	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
148	NC_008496	AT	3	6	18974	18979	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_008496	A	6	6	19043	19048	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_008496	ACT	2	6	19073	19078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_008496	ACAA	2	8	19102	19109	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
152	NC_008496	GTA	2	6	19124	19129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
153	NC_008496	ATA	2	6	19216	19221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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155	NC_008496	AGT	2	6	19275	19280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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159	NC_008496	CAA	2	6	19454	19459	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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162	NC_008496	A	7	7	19501	19507	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_008496	ATA	3	9	19517	19525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_008496	TGT	2	6	19544	19549	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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174	NC_008496	TAA	2	6	19829	19834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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188	NC_008496	T	7	7	21525	21531	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
189	NC_008496	ATT	2	6	21571	21576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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295	NC_008496	AGA	2	6	31069	31074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
296	NC_008496	CT	3	6	31093	31098	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
297	NC_008496	T	10	10	31145	31154	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
298	NC_008496	CTG	2	6	31220	31225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
299	NC_008496	TGG	2	6	31260	31265	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
300	NC_008496	ATG	2	6	31296	31301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
301	NC_008496	A	6	6	31337	31342	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
302	NC_008496	G	7	7	31369	31375	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
303	NC_008496	A	6	6	31386	31391	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
304	NC_008496	AAC	2	6	31403	31408	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
305	NC_008496	ATA	2	6	31442	31447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
306	NC_008496	TAA	2	6	31466	31471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
307	NC_008496	ATA	2	6	31482	31487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
308	NC_008496	T	7	7	31508	31514	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
309	NC_008496	AGG	2	6	31560	31565	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
310	NC_008496	ATT	2	6	31907	31912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
311	NC_008496	TAA	2	6	32021	32026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
312	NC_008496	CCAAT	2	10	32144	32153	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
313	NC_008496	TTG	2	6	32168	32173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
314	NC_008496	ATA	2	6	32219	32224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
315	NC_008496	ATT	2	6	32285	32290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
316	NC_008496	GAG	2	6	32323	32328	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
317	NC_008496	TCAT	2	8	32332	32339	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
318	NC_008496	AGTA	2	8	32360	32367	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
319	NC_008496	ATCA	2	8	33965	33972	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
320	NC_008496	AAC	2	6	34011	34016	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
321	NC_008496	AAAAC	2	10	34024	34033	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
322	NC_008496	ACTAC	2	10	34043	34052	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
323	NC_008496	A	7	7	34069	34075	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
324	NC_008496	TGA	2	6	35260	35265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
325	NC_008496	AAGA	2	8	35280	35287	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
326	NC_008496	AT	3	6	35293	35298	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
327	NC_008496	TA	3	6	35310	35315	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
328	NC_008496	CTT	2	6	35320	35325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
329	NC_008496	GGA	2	6	35353	35358	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.